L'archéologie
Les vestiges archéologiques conservés au musée concernent essentiellement les fouilles archéologiques entreprises au cours des années 1967 à 1972. Les vestiges présentés couvrent les périodes gallo-romaine et médiévale.
Histoire Maritime
La richesse de collections permet de manière générale un tour d’horizon de la pratique de la pêche à pied et des activités professionnelles telles que la conchyliculture et mytiliculture, et de la faune locale.
Les collections traitent également de la navigation, notamment les maquettes de bateaux présentées sont principalement des modèles à voile, et notamment la chaloupe fourasine du début du XXème siècle. Cela permet d'évoquer la pêche, activité importante du port de pêche à cette époque.
Histoire contemporaine
Riche d'un passé militaire important, la ville peut s’enorgueillir d'être également inscrite dans l'histoire contemporaine par le biais d'une histoire entrecroisée entre militaire et balnéaire, portée par l'évolution des côtes françaises soumises dès le XIXème au courant hygiéniste.
Histoire militaire
L'histoire de l'estuaire de la Charente est fort riche. Le musée de Fouras évoque aux travers des différentes collections la présence de la Marine avec la mise en défense de l'arsenal de Rochefort, pièce maîtresse de la marine de Louis XIV.
Mais la richesse de notre passé nous conduit tout naturellement à présenter aussi le passé très mouvementé de la ville sous les périodes antique et médiévale, magnifiquement présenté dans l'écrin de l'ancien donjon.